Tetrahydrochlorid sperminu pro molekulární biologii

Číslo výrobku S1141

CAS RN 306-67-2
EC 206-189-8
Synonyma: N, N'-Bis(3-aminopropyl)-1,4-butandiamintetrahydrochlorid

Popis produktu

Tento produkt je vhodný pro precipitaci DNA z vodných pufrů s nízkým obsahem solí. Byl testován na nepřítomnost proteáz a nukleáz.

Spermin je přirozeně se vyskytující polyamin, který se vyskytuje u všech eukaryot, ale u prokaryot je vzácný. Je nezbytný pro růst buněk v normální i nádorové tkáni.² Spermin vzniká přidáním aminopropylové skupiny na spermidin sperminsyntázou. Spermin má silně bazický charakter a ve vodném roztoku při fyziologickém pH budou všechny jeho aminoskupiny kladně nabité.³ Byl publikován přehled úlohy sperminu a dalších polyaminů při ovlivňování struktury RNA a funkce proteinů.⁴

Spermin se běžně používá v molekulární biologii a biochemickém výzkumu. Poliakationtový charakter sperminu v roztoku umožňuje jeho použití při srážení DNA o délce >100 párů bází z vodných pufrů s nízkým obsahem soli a při izolaci DNA z gelů s pulzním polem.^5,6,7 Spermin byl rovněž využit při izolaci chromosomů a při agregaci chromatinu.^8,9 Lze jej použít jako stavební kámen pro přípravu látek pro přenos genů.^10,11 Byla studována komplexace sperminu s DNA za vzniku částic o průměru <100 nm.¹² Spermin byl použit při krystalizaci DNA.^13,14

Bylo zjištěno, že spermin interaguje s vazebným místem glycinu spojeným s komplexem N-methyl D-aspartátového receptoru.¹⁵ Bylo prokázáno, že spermin inhibuje přeměnu L-argininu na L-citrulin neuronální syntázou oxidu dusnatého v cytosolických preparátech mozečku potkanů a kultivovaných neuronů mozečkových granulí.¹⁶ V akutních hipokampálních řezech působí 1 mM sperminu neuroprotektivně tím, že blokuje NMDA receptor a napěťově aktivované Ca²⁺ kanály.¹⁷ Byl zkoumán vliv sperminu na vazbu MK-801 na rekombinantní N-methyl-D-aspartátové receptory.¹⁸ Pomocí sperminu byly krystalizovány proteiny a proteinové komplexy.^18,19 Mezi další aplikace sperminu patří jeho použití jako matrice v MALDI-MS pro analýzu glykokonjugátů a oligonukleotidů.^19,20

Bezpečnostní opatření a vyloučení odpovědnosti

Tento výrobek je určen pouze pro použití ve výzkumu a vývoji, nikoliv pro léky, domácnost nebo jiné účely. Informace týkající se nebezpečí a bezpečného zacházení naleznete v bezpečnostním listu.

Pokyny pro přípravu

Tento produkt je rozpustný ve vodě (100 mg/ml), přičemž vzniká čirý, bezbarvý až světle žlutý roztok.

Skladování/Stabilita

Roztoky volné báze sperminu se snadno oxidují.

Roztoky jsou nejstabilnější, pokud jsou připraveny v odplyněné vodě a skladovány ve zmražených alikvotech, pod argonem nebo plynným dusíkem.

Profil produktu

Molekulární vzorec: C₁₀H₂₆N₄ - 4HCl
Molekulová hmotnost: 348,18
Bod tání: 312 - 314,5 °C²¹

Odkazy

1. Morgan, D. M. L.. Methods in Molecular Biology, , ed., Humana Press (Totowa, NJ: 1998), pp. 3-30.. Volume 79: Polyamine Protocols

2. Igarashi K, Kashiwagi K. 2000. Polyamines: Mysterious Modulators of Cellular Functions. Biochemical and Biophysical Research Communications. 271(3):559-564. https://doi.org/10.1006/bbrc.2000.2601

3. Davis, et al. LG. , Appleton & Lang (Norwalk, CT: 1994).. Basic Methods in Molecular Biology, 2nd ed.,.

4. Wallace DM. 1987. [5] Precipitation of nucleic acids.41-48. https://doi.org/10.1016/0076-6879(87)52008-0

5. Sambrook J, Russell DW. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed., CSHL Press (Cold Spring Harbor, NY: 2001), ..pp. .5.86-5.88.

6. Cram LS, Campbell M, Fawcett JJ, Deaven LL. 1990. Chapter 36 Polyamine Buffer for Bivariate Human Flow Cytogenetic Analysis and Sorting.377-382. https://doi.org/10.1016/s0091-679x(08)60541-5

7. Marquet, et al. R. The condensation of chromatin and histone H1-depleted chromatin by spermine..

8. Ronsin G, Perrin C, Guédat P, Kremer A, Camilleri P, Kirby AJ. 2001. Novel spermine-based cationic gemini surfactants for gene delivery. Chem. Commun..(21):2234. https://doi.org/10.1039/b105936j

9. Azzam T, Eliyahu H, Shapira L, Linial M, Barenholz Y, Domb AJ. 2002. Polysaccharide?Oligoamine Based Conjugates for Gene Delivery. J. Med. Chem.. 45(9):1817-1824. https://doi.org/10.1021/jm0105528

10. Trubetskoy VS, Wolff JA, Budker VG. 2003. The Role of a Microscopic Colloidally Stabilized Phase in Solubilizing Oligoamine-Condensed DNA Complexes. Biophysical Journal. 84(2):1124-1130. https://doi.org/10.1016/s0006-3495(03)74928-5

11. Shui X, McFail-Isom L, Hu GG, Williams LD. 1998. The B-DNA Dodecamer at High Resolution Reveals a Spine of Water on Sodium?,?. Biochemistry. 37(23):8341-8355. https://doi.org/10.1021/bi973073c

12. Sacaan AI, Johnson KM. Spermine enhances binding to the glycine site associated with the N-methyl-D-aspartate receptor complex. Mol. Pharmacol., 36(6), 836-839 (1989)..

13. Hu J, Mahmoud MI, El-Fakahany EE. 1994. Polyamines inhibit nitric oxide synthase in rat cerebellum. Neuroscience Letters. 175(1-2):41-45. https://doi.org/10.1016/0304-3940(94)91073-1

14. Ferchmin P, Pérez D, Biello M. 2000. Spermine is neuroprotective against anoxia and N-methyl-d-aspartate in hippocampal slices. Brain Research. 859(2):273-279. https://doi.org/10.1016/s0006-8993(00)01973-9

15. Sharma TA, Reynolds IJ. Characterization of the effects of polyamines on [125I]MK-801 binding to recombinant N-methyl D-aspartate receptors. J. Pharmacol. Exp. Ther., 289(2), 1041-1047 (1999)..

16. Xie X, Rao S, Walian P, Hatch V, Phillips GN, Cohen C. 1994. Coiled-coil packing in spermine-induced tropomyosin crystals a comparative study of three forms. Journal of Molecular Biology. 236(4):1212-1226. https://doi.org/10.1016/0022-2836(94)90022-1

17. Qian C, Lagacé L, Massariol M, Chabot C, Yoakim C, Déziel R, Tong L. 2000. A rational approach towards successful crystallization and crystal treatment of human cytomegalovirus protease and its inhibitor complex. Acta Crystallogr D Biol Cryst. 56(2):175-180. https://doi.org/10.1107/s0907444999015103

18. Mechref Y, Novotny MV. 1998. Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry of acidic glycoconjugates facilitated by the use of spermine as a co-matrix. J Am Soc Mass Spectrom. 9(12):1293-1302. https://doi.org/10.1016/s1044-0305(98)00106-8

19. Asara JM, Allison J. 1999. Enhanced Detection of Oligonucleotides in UV MALDI MS Using the Tetraamine Spermine as a Matrix Additive. Anal. Chem.. 71(14):2866-2870. https://doi.org/10.1021/ac981406l

20. Greenstein GR. 2007. The Merck Index: An Encyclopedia of Chemicals, Drugs, and Biologicals (14th edition)2007287Edited by Maryadele J. O'Neil. The Merck Index: An Encyclopedia of Chemicals, Drugs, and Biologicals (14th edition). Whitehouse Station, NJ: Merck & Co. 2006. , ISBN: 978 0 911910 00 1 $125 £59.99 Includes a CD?ROM; distributed in the UK by John Wiley. Reference Reviews. 21(6):40-40. https://doi.org/10.1108/09504120710775534