Přehled kináz rodiny Src
Od chvíle, kdy byl v-Src izolován jako transformační složka viru Rousova sarkomu, a od následné identifikace jeho buněčného homologu c-Src, je o jeho aktivitu a regulaci intenzivní zájem. Src je zakládajícím členem skupiny nereceptorových proteinových tyrozinkináz označovaných jako kinázy rodiny Src (SFK). Všichni členové sdílejí základní mutidoménovou strukturu a vysoký stupeň homologie. SFK lze dále rozdělit na základní skupinu "typických" SFK, kterou u člověka tvoří osm členů (Src, Blk, Fgr, Fyn, Hck, Lck, Lyn a Yes), malou skupinu atypických členů (Brk, Frk a Srm) a dvě blízce příbuzné kinázy (Csk a Matk), které regulují typické SFK.
Typické SFK jsou definovány přítomností pěti domén: Jedinečná oblast proměnlivé délky, která obsahuje na svém krajním amino konci motivy určující modifikaci krátkými mastnými kyselinami palmitátem a/nebo myristátem; doména SH3, která zprostředkovává vazbu na specifické motivy PXXP; doména SH2, která řídí vazbu na specifické fosfotyrosinové zbytky; katalytická doména obsahující tyrosin v aktivační smyčce, jehož fosforylace moduluje katalytickou aktivitu; a krátký karboxykoncový ocas s tyrosinovým zbytkem, jehož fosforylace negativně reguluje enzym. Všichni atypičtí členové mají podobnou strukturu jádra, ačkoli žádný z nich nemá motiv potřebný pro myristaci, a zatímco Frk a Brk mají regulační tyrozin v C-ocasu, Srm nikoli. Kromě toho mají všechny atypické členy v doméně SH2 sekvenci pro jadernou lokalizaci. Regulátory Csk a Matk postrádají myristační motivy, tyroziny v aktivační smyčce a C-koncové regulační ocásky.
Aktivita typických SFK je přesně regulována strukturními omezeními. Obvykle se udržují v "uzavřené" neaktivní formě a na podnět přecházejí do "otevřené" aktivní konformace. Například Src v neaktivní formě je fosforylován v C-koncovém ocásku (tyrozin 530), což je reakce, kterou obvykle provádí Csk. Tato fosforylace podporuje interakci mezi ocasem a doménou SH2, která spolu s druhou intramolekulární interakcí mezi doménou SH3 a sekvencemi spojujícími doménu SH2 a kinázovou doménu podporuje uzavřenou konformaci. Domény SH2 a SH3 jsou maskovány a konformace kinázové domény je pro katalýzu nepříznivá. K přechodu do aktivního stavu může dojít buď defosforylací ocasního tyrozinu, nebo vazbou vysoce afinitních ligandů na domény SH2 a/nebo SH3.
SFK se často aktivují, když se extracelulární ligandy spojí s jejich kognátními receptory (jako jsou receptorové tyrozinkinázy, receptory spřažené s G-proteiny, integrinové receptory a receptory rozpoznávající imunitní systém), a také vnitřně během mitózy. SFK se podílejí na mitogenezi, přežívání buněk, reorganizaci cytoskeletu a motilitě, jakož i na specializovaných funkcích, jako je vývoj imunitních buněk, signalizace neuronálních buněk, funkce osteoklastů a krevních destiček atd. Kromě toho se deregulace a/nebo nadměrná exprese typických i atypických SFK podílí na vzniku rakoviny. V souladu s účastí SFK v mnoha signálních drahách je identifikován velký a stále rostoucí počet substrátů SFK (v současné době jen pro Src více než 50).
Bylo identifikováno několik nízkomolekulárních inhibitorů SFK, z nichž dva (PP2 a SU6656) jsou běžně dostupné. PP2 vykazuje značnou selektivitu pro SFK a může inhibovat Lck a Fyn v nanomolárním rozmezí; je však stejně účinným inhibitorem receptoru PDGF a dalších RTK i Tec kináz. SU6656 inhibuje SFKs ve vysokém nanomolárním rozsahu a neinhibuje receptor PDGF ani Tec, ale je velmi nepravděpodobné, že by byl zcela selektivní pro SFKs. Pokud je to možné, výsledky získané s SFK by měly být potvrzeny druhým inhibitorem nebo pomocí jiných prostředků.
Níže uvedená tabulka obsahuje přijaté modulátory a další informace. Seznam dalších produktů naleznete v "Podobné produkty" části níže.
Podobné produkty
Odkazy
Abyste mohli pokračovat ve čtení, přihlaste se nebo vytvořte účet.
Nemáte účet?