Přejít k obsahu
Merck
DomůAplikaceGenomikaAplikace polymerázové řetězové reakce

Aplikace polymerázové řetězové reakce (PCR)

Kroky RT-PCR od izolace RNA po amplifikaci - PCR s reverzní transkriptázou (RT) probíhá v těchto krocích: izolace RNA nebo mRNA, žíhání primerů, syntéza prvního vlákna a amplifikace PCR.

Polymerázová řetězová reakce (PCR) je výkonná základní technika molekulární biologie, která je účinnou a rychlou in vitro metodou pro enzymatickou amplifikaci specifických sekvencí DNA nebo RNA z různých zdrojů. Standardní PCR se skládá z cílové DNA, sady syntetických oligonukleotidových primerů, které obklopují cílovou sekvenci DNA, termostabilní DNA polymerázy (obvykle Taq polymerázy) a nukleotidů. Při použití termálních cyklérů probíhají během každého amplifikačního cyklu tři fáze, včetně denaturace dvouřetězcové DNA (dsDNA) na samostatnou jednovláknovou DNA, žíhání primerů na cílovou sekvenci DNA a extenze, kdy DNA polymeráza prodlužuje DNA z primerů a vytváří novou dsDNA s jedním starým a jedním novým vláknem. Vlákna syntetizovaná v jednom cyklu slouží jako předloha v dalším cyklu, což vede k milionnásobnému nárůstu množství DNA během pouhých 20 cyklů.



Doporučené kategorie

Molekulární klonování a exprese proteinů
Molekulární klonování a exprese proteinů

Molekulární klonování a metody exprese proteinů a protokoly pro spolehlivé klonování a robustní expresi proteinů z hmyzích, bakteriálních a savčích expresních vektorů.

Obchod s produkty
Epigenetika
Epigenetika

Epigenetická činidla a zdroje pro zkoumání druhů RNA, metylace DNA, modifikací chromatinu a histonů.

Obchod s produkty
Produkty ReagentPlus pro rozpouštědla
Mikrobiom

Komplexní analýza střevního mikrobiomu: Odhalte komplexní řešení zahrnující přípravu vzorků, sekvenování, bioinformatiku a statistiku. Od 16S po WGS.

Obchod s produkty

Reverzní transkriptázová PCR (RT-PCR)

RT-PCR neboli reverzní transkriptázová PCR je varianta standardní techniky PCR, která zahrnuje amplifikaci specifické mRNA získané z velmi malých vzorků. Eliminuje potřebu zdlouhavého procesu čištění mRNA, který je vyžadován u běžných technik klonování. Při RT-PCR se kromě standardních činidel pro PCR používá reverzní transkriptáza a vzorek RNA. Reakční směs se zahřeje na 37 ˚C, což umožní vytvoření komplementární kopie cDNA ze vzorku RNA pomocí reverzní transkriptázy. Tato cDNA se pak annealizuje na jeden z primerů, což vede k syntéze prvního vlákna. Poté následuje standardní PCR, při níž se nakonec vytvoří dsDNA. RT-PCR se často kombinuje s PCR v reálném čase (qPCR), která se hojně využívá ke kvantifikaci hladin transkriptů v buňkách a tkáních.

Hot Start PCR

Hot Start PCR je technologie, která inhibuje horký start Taq polymerázy nebo inkorporaci modifikovaných dNTP během nastavení reakce, dokud nedojde ke kroku tepelné aktivace. K zastavení aktivity polymerázy s horkým startem jsou k dispozici různé metody, mezi něž patří chemická modifikace, metody zprostředkované protilátkami a metody zprostředkované aptamerem. 

Endpoint PCR pro dlouhou a přesnou amplifikaci cílů

Endpoint PCR se často používá ke zjištění přítomnosti cílů a jejich relativního množství po dokončení reakce. Omezená délka sekvencí vznikajících při standardní PCR, přibližně 5 kb, je částečně překonána začleněním dalších faktorů, které zajišťují "proofreading" aktivitu. Dlouhá a přesná (LA) PCR zahrnuje použití druhé termostabilní polymerázy s 3′→5′ exonukleázou k opravě terminálních chybných nukleotidů, což vede k výrazně zvýšené věrnosti a schopnosti amplifikovat cíle DNA o délce až 40 kb.

Vyhledávání dokumentů
Hledáte konkrétnější informace?

Vyhledejte v našem vyhledávači dokumentů datové listy, certifikáty a technickou dokumentaci.

Vyhledat dokumenty

Chcete-li pokračovat, musíte se přihlásit.

Abyste mohli pokračovat ve čtení, přihlaste se nebo vytvořte účet.

Nemáte účet?