E1385

Ethidium bromide solution

BioReagent, 500 μg/mL in H₂O

• Synonim(y): 3,8-Diamino-5-ethyl-6-phenylphenanthridinium bromide, EtBr, Homidium bromide
• Wzór empiryczny (zapis Hilla): C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS Number: 1239-45-8
• Masa cząsteczkowa: 394.31
• Beilstein: 3642536
• Numer MDL: MFCD00011724
• Kod UNSPSC: 41105322
• Identyfikator substancji w PubChem: 24894408
• NACRES: NA.31

Właściwości

• klasa czystości: Molecular Biology
• Poziom jakości: 200
• linia produktu: BioReagent
• stężenie: 500 μg/mL in H₂O
• metody: electrophoresis: suitable
• przydatność: suitable for gel electrophoresis
• ciąg SMILES: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• Klucz InChI: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

Opis

Zastosowanie

Bromek etydyny (EtBr) jest najczęściej stosowanym barwnikiem kwasów nukleinowych do elektroforezy PAGE lub żelu agarozowego. Fluorescencja EtBr wzrasta 21-krotnie po związaniu z dwuniciowym RNA i 25-krotnie po związaniu dwuniciowego DNA, dzięki czemu odbarwianie tła nie jest konieczne przy niskim stężeniu barwnika (10 μg/ml). Bromek etydyny był stosowany w wielu testach fluorymetrycznych dla kwasów nukleinowych. Wykazano, że wiąże się z jednoniciowym DNA (choć nie tak silnie) i trójniciowym DNA. Ze względu na zdolność wiązania się z DNA, EtBr jest inhibitorem polimerazy DNA.

Ethidium bromide solution has been used to deplete mtDNA to investigate mitochondrial damage signals in autophagy. It has also been used to detect DNA damage using comet assay.

Działania biochem./fizjol.

Bromek etydyny interkaluje dwuniciowe DNA i RNA i działa jako mutagen z przesunięciem ramki. Może być również stosowany w połączeniu z oranżem akrydyny w celu rozróżnienia między żywymi, apoptotycznymi i nekrotycznymi komórkami.

Rekonstytucja

W celu wybarwienia żelu po elektroforezie należy rozcieńczyć próbkę roztworu podstawowego do 0,5 μg/ml wodą i inkubować żel przez 15-30 minut. Odbarwianie zwykle nie jest konieczne, ale można je przeprowadzić w wodzie przez 15 minut, jeśli konieczne jest zmniejszenie tła. Prążki DNA można następnie wykryć w lampie UV (długość fali 254 nm). Bromek etydyny można również dodać do żelu i buforu roboczego w stężeniu 0,5 μg/ml i wizualizować natychmiast po elektroforezie.

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Kod klasy składowania: 12 - Non Combustible Liquids
• Klasa zagrożenia wodnego (WGK): nwg
• Temperatura zapłonu (°F): Not applicable
• Temperatura zapłonu (°C): Not applicable