핵산 겔 전기영동법
핵산 겔 전기영동법은 크기와 전하에 따른 DNA 및 RNA 절편의 분리, 식별 및 정제를 위한 분자생물학 기술입니다. 이 기술에서, DNA 및 RNA 분자는 전기장을 적용하여 분리하며 음전하를 가진 핵산은 아가로스 또는 폴리아크릴아마이드 겔 매트릭스를 통해 이동합니다.
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겔 매트릭스는 체처럼 행동하여, 겔의 구멍을 통해 짧은 분자가 긴 분자보다 더 빠르게 통과하도록 합니다.
- 아가로스 겔은 DNA 및 RNA 전기영동을 위해 더 일반적으로 사용되며 표준 전기영동법을 활용하여 50 염기쌍(50 bp)에서 50,000 bp 크기의 DNA 절편을 분리할 수 있습니다.
- 폴리아크릴아마이드 겔은 작은 범위의 분리능을 가지며 상당히 높은 해상력으로 약 500 bp 미만의 DNA 절편을 분리할 수 있습니다.
- 아가로스와 폴리아크릴아마이드 겔 모두 단백질 핵산 상호작용을 규명하기 위한 전기영동 이동성 변화 분석(EMSA)에 사용될 수 있습니다.
전기영동 이후에, DNA 및 RNA 분자는 염료 또는 UV광을 사용하여 가시화될 수 있으며, 겔에서 추출 및 정제되거나 블로팅을 위해 전이될 수 있습니다. 이러한 방법은 클로닝, PCR, 질량 분광분석법, 차세대 염기서열분석(NGS) 그리고 노던 및 서던 블로팅(blotting) 애플리케이션 및 작업흐름에서 일반적인 준비 기법입니다.
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